计算机辅助药物设计理论及应用_PDF下载[93MB-百度云]胡建平

本书特色

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计算机辅助药物设计以化学和生物理论为基础，通过分子模拟、预测药物与靶点之间的分子识别，设计和优化先导化合物，在新药研发中发挥着不可或缺的作用。《计算机辅助药物设计理论及应用》针对学生在计算机辅助药物设计学习过程中可能遇到的各种问题，介绍了数据库、定量构效关系、药效团、分子对接、虚拟筛选、同源模建、分子动力学模拟、自由能计算理论以及药物设计过程中常用软件和数值计算方法。《计算机辅助药物设计理论及应用》覆盖全面，简单实用，加入了大量应用实例，穿插操作方法和技巧；每个章节自成体系，从易到难，层次分明。

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目录**章绪论（1）**节新药开发的基本途径和方法（1）第二节计算机辅助药物设计的常用研究方法（10）第三节计算机辅助药物设计的常用软件（14）第四节近年来CADD在药物设计中的应用实例（19）参考文献（21）第二章计算机辅助药物设计的相关基础（23）**节计算机辅助药物设计的生命科学基础（23）第二节计算机辅助药物设计的药学基础（40）第三节计算机辅助药物设计的Linux基础（48）参考文献（62）第三章常用数据库和基础软件的使用（64）**节药物设计常用数据库（64）第二节药物和靶点的三维结构显示及绘制软件（79）第三节 EndNote文献管理（85）参考文献（91）第四章基于配体的药物分子设计（92）**节定量构效关系（QSAR）（92）第二节药效团模型（119）参考文献（125）第五章基于受体的药物分子设计（129）**节分子对接的原理和分类（129）第二节分子对接的搜索算法（130）第三节分子对接的打分函数（134）第四节分子对接的操作流程（138）第五节分子对接实例（144）第六节虚拟筛选实例（147）参考文献（153）第六章蛋白质结构预测及全新药物设计（158）**节同源建模（158）第二节同源模建实例（171）第三节蛋白质结合位点预测（178）第四节全新药物设计方法（182）参考文献（186）第七章分子动力学模拟（190）**节分子动力学模拟的原理（190）第二节恒温恒压分子动力学模拟与溶剂模型（196）第三节分子动力学模拟的主要步骤（201）第四节分子动力学模拟应用实例（210）参考文献（231）第八章结合自由能的计算（234）**节生物大分子体系结合自由能研究的背景及意义（234）第二节结合自由能计算方法（238）第三节基于MM/PBSA自由能算法的操作实例（241）第四节自由能计算实例（247）参考文献（258）第九章药物靶点的构象分析（260）**节药物靶点基础（260）第二节粗粒化模型（262）第三节自由能曲面（275）第四节聚类分析（279）第五节自由能曲面和聚类分析实例（282）第六节 ProDy使用（286）参考文献（291）第十章药物设计常用的数值分析（295）**节相关和回归分析（295）第二节 ROC曲线（305）第三节基于贝叶斯分类的类药性预测（313）第四节 Matlab在药物设计中的应用（322）参考文献（337）附录常用Linux计算软件的安装（339）中英文对照索引（347）附图（363）