差异表达基因检测统计方法研究

本书特色

[

　 纪兆华*的《差异表达基因检测统计方法研究》 针对差异基因表达样本表达强度值状态检测的特点， 研究变点检测理论应用到差异表达基因检测的实用化 方法，并设计基于变点原理的检测方法应用于差异表 达基因检测。根据差异表达基因表达值分布状态的特 点，模拟生成基因表达谱数据阵列，研究基于变点的 差异表达基因检测问题的具体特征。给出变点的检测 和估计(点估计和区间估计)以及估计量的渐近分布和 收敛速度，*终实现检测差异表达基因的目的。讨论 变点检测方法和R0c接受者操作曲线来研究变点检测 方法的统计性能分析方法和参数优化的方法。通过蒙 特卡洛马尔可夫方法对检测方法进行验证，证明基于 变点的差异表达基因检测方法的有效性。把*大似然 比检验方法、*小二乘法应用到差异表达基因检测， 对基因表达谱模型统计推断，考虑变点的检验或点估 计。

]

目录

第1章 绪论1.1 生物芯片概述1.2 基因芯片简介1.2.1 基因芯片的原理1.2.2 基因芯片的分类1.2.3 基因芯片的应用1.3 基因芯片数据差异表达基因检测统计方法1.3.1 差异表达基因检测概述1.3.2 传统差异表达基因检测方法1.3.3 其他相关的差异表达基因检测方法1.4 变点问题的研究1.5 变点理论应用于差异表达基因检测1.6 微阵列基因芯片数据的网络资源介绍1.7 本书的研究内容
第2章 差异表达基因检测样本子集过表达的统计方法2.1 生物学背景2.2 差异表达基因检测统计方法介绍2.2.1 基于均值的差异表达基因检测方法2.2.2 基于中值的差异表达基因检测方法2.2.3 基于样本表达值特定百分比的差异表达基因检测方法2.3 实验与分析2.3.1 ROC曲线比较2.3.2 FDR曲线比较2.3.3 算法分析2.4 讨论
第3章 TriORT差异表达基因检测统计方法3.1 引言3.2 TriOTR方法3.3 实验与分析3.3.1 仿真研究3.3.2 真实数据研究3.4 小结
第4章 TriMOST差异表达基因检测统计方法4.1 引言4.2 TriMOST方法4.3 实验与分析4.3.1 仿真研究4.3.2 真实数据研究4.4 小结
第5章 差异表达基因检测统计方法在乳腺癌数据上的应用5.1 引言5.2 差异表达基因检测方法5.2.1 已有方法介绍5.2.2 TriORT方法和TriMOST方法5.3 实验与分析5.3.1 ROC曲线仿真实验5.3.2 FDR曲线仿真实验5.3.3 真实数据集实验5.3.4 各方法找到的和乳腺癌相关的基因分析5.4 小结
第6章 变点理论统计分析6.1 引言6.2 基于变点理论的统计方法6.2.1 变点6.2.2 检测变点的常用方法6.3 变点理论的应用6.3.1 变点的统计推断问题研究6.3.2 采用贝叶斯法检测多个变点的基因表达谱数据6.3.3 癌症差异表达基因检测6.4 变点统计分析方法在差异表达基因检测中的应用6.5 小结
第7章 基于样本子集的差异表达基因检测方法比较7.1 引言7.2 差异表达基因检测方法7.2.1 T统计方法7.2.2 相对正常组样本的半T统计方法7.2.3 相对癌症组样本的半T统计方法7.2.4 增加参数的半T统计方法7.3 实验和结果分析7.3.1 基因表达强度相同时，差异表达基因数目变化7.3.2 差异表达基因数目相同时，增加的基因表达强度变化7.3.3 基因表达强度相同，差异表达基因数目相同，基因数目不同7.3.4 基因表达强度相同，差异表达基因数目相同，基因数目相同时，样本数目不同7.4 小结
第8章 基于变点理论的差异表达基因检测8.1 引言8.2 差异表达基因检测的生物信息学基础8.3 差异表达基因检测方法8.3.1 T检验方法8.3.2 PPST置换百分比分离测试方法8.3.3 LRS基于似然率方法8.3.4 基于*小二乘法的变点差异表达基因检测8.4 差异表达基因检测方法性能评价8.5 乳腺癌公共数据库数据研究分析8.6 小结
第9章 总结与展望9.1 总结9.2 展望
参考文献

封面

书名:差异表达基因检测统计方法研究

作者:纪兆华

页数:138页

定价:¥38.0

出版社:北京理工大学出版社

出版日期:2017-05-01

ISBN:9787568238403

PDF电子书大小:55MB 高清扫描完整版