肿瘤信息学
本书特色
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深入解读癌症本质,是人类在新世纪面临的重大挑战。
《肿瘤信息学》从生物信息学角度,利用现有多种组学数据对癌症的生物学特征予以描述归纳及探讨,指出癌症是一个进化复合体系统,要以“整体论”来思考研究,并提供了理论框架。
《肿瘤信息学》分为14章,探讨了癌症的生物学基础、利用组学数据从分子及基因组层面理解癌症发生发展的驱动力、癌细胞在多重压力下存活的路径、表观遗传应答的作用、癌症侵袭和转移的原因、癌症转移后的特征等。此外,还示范了癌症标志物的发掘以及利用计算手段研究癌症的策略等。
希望《肿瘤信息学》能部分地弥合实验癌症生物学家和计算生物学家之间的沟壑;也希望基础医学、临床医学、生物信息学的研究者们能掌握独特的思维方式,从而加速各自的相关研究。
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内容简介
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目录
第1章 癌症的生物学基础1.1 癌症概述1.2 癌症的特征性标志1.3 原癌基因、癌基因与抑癌基因1.4 癌症基因组、肿瘤异质性和癌症进化的**成果1.5 早期的癌症发展的序贯模型1.6 表观遗传学与癌症1.7 癌细胞的能量代谢1.8 人们逐渐认识到了低氧、炎症及ROS在癌症中的作用1.9 克服凋亡1.10 细胞外基质和间质对癌症的作用1.11 癌症的分类与诊断中具有挑战性的问题1.12 小结参考文献第2章 组学数据——信息之源与计算之需2.1 基因组序列数据2.2 表观遗传学组学数据2.3 转录组学数据2.4 代谢组学数据2.5 患者信息数据2.6 组学数据整合分析案例研究2.7 小结参考文献第3章 癌症分类与分子信号识别3.1 癌症类型、病理分级和发展阶段3.2 通过数据分析确定癌症的类型、阶段和分化程度3.3 通过数据聚类发现亚型、亚期和亚分化程度3.4 挑战性问题3.5 小结补充材料参考文献第4章 从基因组层面理解癌症4.1 癌症基因组的基本信息4.2 癌症基因组数据的一般信息4.3 从通路层面考虑驱动突变:案例研究4.4 癌症基因组突变数据的(潜在)信息4.5 基于细胞系研究的局限性:微环境驱动癌症的前奏4.6 小结参考文献第5章 通过比较组学分析阐明癌症的驱动力5.1 关于癌症驱动力的两种不同学说5.2 结直肠癌的基于卸C基因突变的驱动模型5.3 w砷urg理论:能量代谢的改变是癌症的驱动力5.4 细胞增殖是一种逃生方式:我们的驱动模型5.5 基因突变在肿瘤发生中的作用5.6 外源性因素与癌症5.7 小结补充材料参考文献第6章 透明质酸:癌症进化的重要促进因素6.1 透明质酸及其生理功能6.2 透明质酸:链接了癌症的形成与发展6.3 透明质酸驱动癌症形成与发展的模型6.4 生物信息学的机遇与挑战6.5 小结参考文献第7章 多种逃生路径——理解癌细胞如何逃避凋亡7.1 细胞凋亡的生物学基础7.2 癌症逃避细胞凋亡的不同方式7.3 癌症为避免凋亡所获得的特征7.4 小结补充材料参考文献第8章 癌症在竞争性恶劣环境中的发展8.1 生长组织中存在细胞.细胞间竞争8.2 乳酸酸性环境中的癌细胞与正常细胞8.3 免疫监控下的癌症发展8.4 免疫和癌症进化之间的详细关系8.5 小结补充材料参考文献第9章 表观遗传应答导致细胞增殖失控9.1 肿瘤细胞进化导致的微环境改变9.2 表观遗传应答:细胞应对反常、持续性压力的通用应激系统9.3 基因组不稳定性与癌症的发展9.4 小结补充材料参考文献第10章 理解癌症的侵袭和转移10.1 肿瘤细胞的局部侵袭10.2 肿瘤细胞的迁移10.3 适应新的微环境10.4 透明质酸是转移的关键推动者10.5 小结补充材料参考文献第11章 转移后的癌症——第二次转化11.1 转移癌与原发癌迥异的共同特征11.2 细胞如何应对微环境的改变11.3 理解转移癌的加速生长:一种数据挖掘的方法11.4 小结补充材料参考文献第12章 搜寻人类体液中的癌症标志物12.1 疾病诊断中的标志物识别的历史回顾12.2 使用自上向下的方法搜索生物标志物12.3 预测分泌和循环蛋白:一种数据挖掘方法12.4 搜寻其他的人类体液中生物标志物12.5 搜寻其他分子中的生物标志物12.6 小结参考文献第13章 在公共数据基础上利用计算手段研究癌症13.1 挖掘癌症组学数据可以解答的一些潜在问题13.2 对以计算方式研究癌症具有帮助的数据库13.3 对于以计算方式研究癌症有帮助的网络工具13.4 小结参考文献第14章 我们的观点——把癌症当成一个进化复合体系统来理解14.1 什么是癌症14.2 癌细胞必须克服哪些压力呢14.3 压力vs.增殖14.4 不同的癌有不同的生存之道14.5 组织水平vs.细胞水平的问题14.6 整体论vs.还原论参考文献
封面
书名:肿瘤信息学
作者:徐鹰
页数:287
定价:¥118.0
出版社:科学出版社
出版日期:2016-06-01
ISBN:9787030475558
PDF电子书大小:37MB 高清扫描完整版
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